SPT Labtech宣布与Thermo Fisher Scientific合作,推出低成本自动化NGS建库解决方案
文库制备成本在如今大规模的NGS研究费用中所占的比重越来越重,经费和成本的限制阻碍了科学家对传染病监测、癌症研究等领域更深入探索的步伐。SPT Labtech宣布与Thermo Fisher Scientific进行市场合作,旨在构建自动化的文库制备方案,以期提高建库成功率,并降低variant检测的费用。
高灵敏度的variant检测现在可以通过使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系统进行自动化建库,将反应体系微缩化,减少试剂使用量,降低1/10的成本,从而能够在一组样本中添加更多的replicates,提高建库成功率和测序数据质量。
此项方案将首先支持用于Illumina系统的Invitrogen Collibri全基因组测序文库制备试剂盒,以及Collibri文库定量试剂盒,包括SARS-CoV-2研究、癌症研究中拷贝数变异以及其他突变检测的应用。
更高的效率
SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系统可以快速编程,24/7全天候进行样本制备工作,解放研究人员的时间。
更高的成功率
使用SPT Labtech设备进行微缩化建库,可将试剂的用量体积减少多达10倍,从而可以用不到1个样本的成本,做5–6个replicates。样本重复数量的增加,保障了即使某个样品在flow cell上测序失败,仍有其他样品的数据可以使用,无需再重新准备样本展开测序,从而确保了实验一次成功。Invitrogen Collibri NGS文库制备试剂盒中每种试剂含有一种示踪染料,通过颜色变化可清晰观察文库制备过程,避免高代价的实验失误。
更微量的样本
SPT Labtech设备独有的固相置换技术可以精确地处理微量液体,对0.5uL的粘稠样本都有着极高的加样精度。Invitrogen Collibri全基因组测序文库制备试剂盒可从1 ng的样本起始量提供均匀的基因组覆盖度。Collibri ES DNA PCR-free建库方案经过优化,可将 100 ng DNA 制备成足量测序文库,足以用于文库定量及在 Illumina NovaSeq 系统上进行两次以上测序。PCR-free的建库流程可在1.5小时内完成,一天内就可以将DNA转化为数据,从而最大限度地提高实验效率。
加速科学发现:提高实验成功率并降低研究成本
SPT Labtech的产品战略总监Joby Jenkins表示,在不牺牲结果质量的前提下降低NGS建库成本是朝着科学民主化迈出的一大步。NGS技术发展迅速,对于每个实验室来说,将最新的建库方法进行自动化的流程搭建将会非常耗时,而我们的目标就是实现NGS建库过程的自动化和微缩化,解决技术和方法上的挑战,这样科学家们就可以更关注于科学问题本身,扩大他们研究项目的范围,最终对生命科学和人类健康产生更深刻的见解。